More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1365 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1365  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
132 aa  265  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  74.8 
 
 
131 aa  189  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
137 aa  183  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
136 aa  183  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  75 
 
 
138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  75 
 
 
138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  75 
 
 
138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1135  ribosomal protein S11  74.4 
 
 
133 aa  176  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168888  normal  0.0833424 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  68.18 
 
 
132 aa  176  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  65.35 
 
 
129 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 
129 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 
139 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  73.02 
 
 
135 aa  174  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  70 
 
 
132 aa  174  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  70.16 
 
 
138 aa  174  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  173  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  68.35 
 
 
139 aa  173  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
129 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
129 aa  173  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
129 aa  173  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0653  ribosomal protein S11  74.38 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  73.55 
 
 
135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  70.4 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  66.12 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 
129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 
129 aa  170  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  71.07 
 
 
131 aa  170  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
138 aa  170  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 
129 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 
129 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 
129 aa  170  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  170  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2130  30S ribosomal protein S11  67.52 
 
 
135 aa  169  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.012863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  69.35 
 
 
137 aa  169  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  73.98 
 
 
132 aa  169  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16910  SSU ribosomal protein S11P  71.9 
 
 
134 aa  169  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  73.55 
 
 
136 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 
131 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29470  SSU ribosomal protein S11P  74.38 
 
 
135 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0093892  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  67.83 
 
 
131 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 
129 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
133 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  58.02 
 
 
134 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  58.02 
 
 
134 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  58.02 
 
 
134 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 
130 aa  167  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 
130 aa  167  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  73.55 
 
 
133 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
135 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  61.42 
 
 
129 aa  167  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
135 aa  166  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
134 aa  166  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2656  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 
133 aa  166  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  165  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  72.36 
 
 
132 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  165  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  60.63 
 
 
129 aa  165  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 
129 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2627  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
133 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  64.66 
 
 
129 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 
131 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  69.29 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 
134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  72.73 
 
 
135 aa  164  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 
130 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 
129 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
135 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 
134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 
131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 
136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 
134 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  54.96 
 
 
134 aa  163  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 
130 aa  163  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6585  30S ribosomal protein S11  77.39 
 
 
135 aa  163  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>