197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3026 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3026  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 160 aa  330  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0124  GreA/GreB family elongation factor  25 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000349416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  32.69 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  40.28 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  26.11 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  28.79 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  30.94 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  28.57 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  30.77 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  26.67 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  30.77 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  29.46 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  29.63 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  30 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  30 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  31.07 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  44.07 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  29.23 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  30.77 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  29.13 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  46.94 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  33.64 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2677  GreA/GreB family elongation factor  39.34 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  28.46 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  28.46 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  28.46 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  28.91 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0552  GreA/GreB family elongation factor  33.03 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0537746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3981  transcription elongation factor GreB  38.37 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  27.13 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  30.63 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0171  transcription elongation factor GreB  38.37 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  31.73 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6110  transcription elongation factor GreB  38.89 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2487  transcription elongation factor GreA  27.67 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  26.92 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  28 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1778  transcription elongation factor GreB  40.62 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  26.36 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  44.9 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  25.44 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  28.68 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  25.44 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  26.36 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  39.68 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  31.78 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  27.78 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  25.44 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  46.94 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2863  transcription elongation factor GreB  29.35 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  32.04 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2863  transcription elongation factor GreB  35.38 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  30.1 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  25.66 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  27.18 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  27.91 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  33.75 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  27.13 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  25 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  31.48 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  26.15 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  44.9 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  32.53 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  33.94 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  33.94 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  30.1 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  26.56 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  26.15 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0718  GreA/GreB family elongation factor  39.68 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.188728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0731  GreA/GreB family elongation factor  39.68 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000249638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1103  GreA/GreB family elongation factor  37.5 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000308289  normal  0.0184015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  28.44 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3810  transcription elongation factor GreB  41.54 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0355529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3886  GreA/GreB family elongation factor  41.54 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  30.58 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  32.43 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  32.18 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  24.06 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  26.21 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  29.31 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  30 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>