More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0124 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0124  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000349416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3026  GreA/GreB family elongation factor  25 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525823  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  26.62 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  24.03 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  30.11 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  31.37 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  28.97 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  32.67 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  33.67 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  32.71 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  31.19 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  23.03 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  26.17 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  25 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  22.88 
 
 		 266 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  30.28 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  34.44 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  30.43 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  34.44 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  23.78 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  24.03 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  26.72 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  25.96 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  21.71 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  25.97 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  31.68 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  28.7 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0226  GreA/GreB family elongation factor  27.56 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  27.36 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  27.36 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  29.7 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  23.36 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  28.85 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  21.15 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  27.37 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  30.97 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  27.59 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  28.42 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  24.53 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  24.3 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  28.42 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  24.53 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  28.18 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  31.68 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  39.44 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2677  GreA/GreB family elongation factor  34.65 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  27.72 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  23.28 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  28.83 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  28.44 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  25.51 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  36.62 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  27.37 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  23.68 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  25.47 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  29.52 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  37.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  30.09 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  25.74 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  29.36 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  28.7 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  26.92 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  32.32 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  28.04 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  26.67 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  27.52 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  26.42 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  25 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  24.49 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  26.42 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  26.42 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  29.7 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  34.78 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2439  GreA/GreB family elongation factor  29.17 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.53046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  25 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2621  GreA/GreB family elongation factor  32.29 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.603501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  27.72 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  26.32 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  27.72 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  30.28 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  27.72 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  25.47 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  27.72 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>