More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6136 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6136  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
293 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4474  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.32 
 
 
286 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
277 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2609  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
277 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5289  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
278 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.14 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2528  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.67 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0119  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
281 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.74 
 
 
277 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10193  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.33 
 
 
281 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5535  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
316 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.050096 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6843  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
329 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4027  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.947056  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
259 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.99 
 
 
260 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 
267 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
257 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 
266 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
257 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
260 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.39 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.41 
 
 
661 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.36 
 
 
663 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3319  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.15 
 
 
270 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00893563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
258 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3616  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.88 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
262 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
258 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 
259 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1693  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.39 
 
 
659 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
257 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
259 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.99 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.72 
 
 
662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
262 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 
268 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.93 
 
 
657 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.22 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
259 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
257 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 
260 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
257 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.94 
 
 
278 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
256 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
259 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.49 
 
 
662 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 
257 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 
257 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.83 
 
 
260 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 
257 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 
258 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
259 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.51 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 
267 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.31 
 
 
260 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
262 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
259 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
260 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
259 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1190  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 
258 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
260 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
260 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
257 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
267 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
258 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.12 
 
 
253 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>