More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3319 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3319  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00893563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3616  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  85.93 
 
 
270 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2528  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.51 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4474  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 
286 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
281 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0119  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
281 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10193  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.13 
 
 
281 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2609  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.51 
 
 
277 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6136  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
293 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  28.46 
 
 
258 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  25.49 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5289  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.57 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.31 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1693  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.9 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.51 
 
 
260 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  29.51 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.71 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.51 
 
 
260 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  25.97 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  25.97 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  29.47 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.51 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4027  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.947056  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.47 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  31.32 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.42 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5535  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.77 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.050096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.19 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  30.06 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.25 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  27.57 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  28.18 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6843  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.62 
 
 
329 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.78 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  26.84 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.21 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  25.86 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.12 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  28.71 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  28.65 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  24.64 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.03 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  27.47 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.49 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.94 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  27.07 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  27.07 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.66 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.58 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.34 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  28.49 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  25.6 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  25.6 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  25.6 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  27.72 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.22 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>