More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3001 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3001  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 437 aa  891    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000734369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  69.79 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  67.28 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  67.51 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.74 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.27 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.04 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  65.42 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 431 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 431 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  63.36 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.49 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.27 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  62.36 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  62.96 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  61.21 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  61.95 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.31 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  61.95 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  60.42 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  60.88 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  61.29 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.57 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  60.51 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  60.46 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  60.97 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  60.88 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  62.88 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  62.18 
 
 		 429 aa  531  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  59.53 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  57.97 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  60.14 
 
 		 430 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  61.07 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  58.74 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  57.97 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  60.23 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  59.26 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  58.66 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  61.21 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  60.84 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  60.6 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  60.23 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  58.66 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  59.35 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  59.72 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  58.89 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  61.31 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2794  enolase  63.47 
 
 		 430 aa  521  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  59.72 
 
 		 427 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  59.18 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  59.95 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  60.64 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  60.42 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  58.89 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  60.42 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  61.83 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  60.42 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  59.26 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  59.07 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  59.26 
 
 		 428 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  58.64 
 
 		 437 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  58.56 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  60.56 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  59.63 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  59.12 
 
 		 428 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  59.12 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  59.86 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  59.07 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  59.68 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  59.95 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  57.51 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  59.32 
 
 		 437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  58.96 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  58.93 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  59.48 
 
 		 431 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  59.18 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  59.32 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  57.81 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  57.51 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  58.62 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  58.97 
 
 		 425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  58.7 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  59.11 
 
 		 430 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  58.33 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  57.74 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  58.05 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>