239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0930 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  100 
 
 
450 aa  897    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  63.07 
 
 
450 aa  504  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  51.98 
 
 
508 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  45.09 
 
 
449 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  52.41 
 
 
433 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  47.55 
 
 
450 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  46.57 
 
 
440 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  59.11 
 
 
427 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  58.47 
 
 
426 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  43.24 
 
 
514 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  58.47 
 
 
426 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  49.34 
 
 
488 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  46.39 
 
 
448 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  48.22 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  41.22 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  53.42 
 
 
444 aa  335  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  45.01 
 
 
495 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  45.01 
 
 
495 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  44.71 
 
 
491 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  44.71 
 
 
491 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  44.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  45.45 
 
 
491 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  42.96 
 
 
440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  43.46 
 
 
438 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  44.79 
 
 
492 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  51.36 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  52.41 
 
 
566 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  45.62 
 
 
494 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  52.09 
 
 
566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  46.1 
 
 
445 aa  326  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  48.96 
 
 
457 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  44.78 
 
 
492 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  45.23 
 
 
481 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  45.18 
 
 
441 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  48.17 
 
 
518 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  44.24 
 
 
491 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  51.53 
 
 
482 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  42.99 
 
 
445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  52.38 
 
 
621 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  43.72 
 
 
456 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  43.72 
 
 
456 aa  319  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  48.53 
 
 
466 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  48.82 
 
 
490 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  48.4 
 
 
774 aa  316  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  43.31 
 
 
455 aa  316  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  52.9 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  47.83 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  49.7 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  49.53 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  42.34 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  51.25 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  49.11 
 
 
490 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  43.3 
 
 
495 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  39.18 
 
 
432 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  38.89 
 
 
451 aa  229  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  33.13 
 
 
427 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  25.78 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  26.44 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  26.44 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  28.38 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  29.69 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  26.7 
 
 
439 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  26.7 
 
 
426 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  27.74 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  29.86 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  28.19 
 
 
387 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  28.48 
 
 
457 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  26.73 
 
 
410 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  25.23 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  25.84 
 
 
366 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  26.14 
 
 
410 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  25 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  26.69 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  25.17 
 
 
405 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  26.37 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  25 
 
 
407 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  25.91 
 
 
392 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  25.28 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  29.18 
 
 
428 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  25.19 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  25.19 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  25.19 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  24.66 
 
 
400 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  24.32 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  25.98 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  22.98 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  22.42 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  22.12 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  26.78 
 
 
503 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  27.24 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  27.97 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  27.27 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  22.04 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  26.54 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>