220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2808 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  99.8 
 
 
491 aa  972    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  87.42 
 
 
492 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  87.17 
 
 
492 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  78.65 
 
 
482 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  97.21 
 
 
491 aa  868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  78.09 
 
 
481 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  87.15 
 
 
495 aa  789    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  88.91 
 
 
491 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  86.71 
 
 
495 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  88.69 
 
 
491 aa  761    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  88.91 
 
 
491 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  76.96 
 
 
494 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  99.8 
 
 
491 aa  972    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  99.8 
 
 
491 aa  972    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  100 
 
 
491 aa  974    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  100 
 
 
491 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  99.8 
 
 
491 aa  972    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  72.06 
 
 
457 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  69.6 
 
 
488 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  70.13 
 
 
490 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  72.79 
 
 
490 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  65.02 
 
 
448 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  59.68 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  59.68 
 
 
445 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  57.96 
 
 
466 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  60.67 
 
 
479 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  59.28 
 
 
426 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  55.14 
 
 
444 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  62.72 
 
 
495 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  58.85 
 
 
455 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  59.21 
 
 
518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  52.51 
 
 
450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  57.67 
 
 
774 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  60.33 
 
 
449 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  52.49 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  48.51 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  55.15 
 
 
456 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  55.39 
 
 
456 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  49.47 
 
 
508 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  64.44 
 
 
433 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  58.15 
 
 
566 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  57.88 
 
 
566 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  66.37 
 
 
426 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  65.79 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  54.36 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  65.5 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  53.88 
 
 
474 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  58.87 
 
 
509 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  55.44 
 
 
440 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  53.43 
 
 
621 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  44.79 
 
 
465 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  42.89 
 
 
445 aa  360  4e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  44.95 
 
 
412 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  51.26 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  45.73 
 
 
449 aa  348  1e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  44.9 
 
 
450 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  44.82 
 
 
424 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  44.04 
 
 
424 aa  306  7e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  42.9 
 
 
451 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  38.07 
 
 
432 aa  282  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  41.45 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  25.91 
 
 
453 aa  144  5e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  28.68 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  28.89 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  24.86 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  29.84 
 
 
448 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  29.63 
 
 
387 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  30.77 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  30.4 
 
 
378 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  30.4 
 
 
378 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  27.71 
 
 
420 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  27.71 
 
 
420 aa  114  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  27.57 
 
 
417 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  24.63 
 
 
426 aa  109  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  23.59 
 
 
439 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  28.28 
 
 
410 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  27.65 
 
 
366 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  26.3 
 
 
457 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  23.1 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  29.64 
 
 
410 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  29.08 
 
 
405 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  27.11 
 
 
410 aa  90.5  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  27.66 
 
 
409 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  24.02 
 
 
412 aa  87  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  26.98 
 
 
405 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  27.92 
 
 
407 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  27.4 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  23.24 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  28.4 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  30.3 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  29.2 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  26.74 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  27.11 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  27.11 
 
 
407 aa  77  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  28.72 
 
 
446 aa  77  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  26.51 
 
 
390 aa  77  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  26.02 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  26.39 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  27.48 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>