244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0770 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  870    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  60.71 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  57.95 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  54.78 
 
 		 380 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  50.68 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  55.17 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  55.17 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  43.1 
 
 		 420 aa  346  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  43.1 
 
 		 420 aa  346  5e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  47.37 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  50.18 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  45.33 
 
 		 411 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  45.28 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  40.32 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  40 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  40 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  40.18 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  41.59 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  41.5 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  44.17 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  43.46 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  43.46 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  40.78 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  38.85 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  39.54 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  37.91 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  38.7 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  40.91 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  36.83 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  36.24 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  36.54 
 
 		 405 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  36.28 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  35.81 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  34.66 
 
 		 359 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  36.54 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  34.46 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  25.6 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  26.99 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  27.79 
 
 		 514 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  30.42 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  26.75 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  27.04 
 
 		 479 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  28.81 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  30.63 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  28.78 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  28.42 
 
 		 488 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  28.19 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  27.91 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  27.34 
 
 		 508 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  32.12 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  27.46 
 
 		 495 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  31.88 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  30.09 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  28.82 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  28.14 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  28.14 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  30.66 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  29.86 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  28.19 
 
 		 621 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  27.27 
 
 		 492 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  30.92 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  27.42 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  26.24 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  29.21 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  24.87 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  28.68 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  28.87 
 
 		 491 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  26.82 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  27.67 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  27.74 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  26.23 
 
 		 566 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  26.65 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  26.23 
 
 		 566 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  24.37 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  25.97 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  23.15 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  23.76 
 
 		 424 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  26.28 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  26.68 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  23.15 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  29.97 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  26.33 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  27.44 
 
 		 450 aa  106  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  26.8 
 
 		 774 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  25.7 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  27.75 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  25.27 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  27.32 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  27.2 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  25.53 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  27.35 
 
 		 481 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  26.4 
 
 		 498 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  27.08 
 
 		 482 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  25.69 
 
 		 522 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>