236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1514 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  971    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  63.81 
 
 
479 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  60.62 
 
 
495 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  60.84 
 
 
491 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  60.18 
 
 
495 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  60.84 
 
 
491 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  60.33 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  62.61 
 
 
457 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  58.24 
 
 
494 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  61.5 
 
 
492 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  61.85 
 
 
492 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  58.77 
 
 
455 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  58.49 
 
 
490 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  58.04 
 
 
445 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  61.06 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  63.23 
 
 
491 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  60.72 
 
 
466 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  62.64 
 
 
491 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  59.59 
 
 
488 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  58.69 
 
 
490 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  60.36 
 
 
481 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  58.37 
 
 
482 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  56.08 
 
 
426 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  55.38 
 
 
448 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  65.5 
 
 
444 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  57.61 
 
 
449 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  60.66 
 
 
440 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  55 
 
 
450 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  47.42 
 
 
514 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  47.41 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  47.38 
 
 
440 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  63.52 
 
 
433 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  51.74 
 
 
508 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  51.6 
 
 
518 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  51 
 
 
566 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  51.24 
 
 
566 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  59.59 
 
 
426 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  59.59 
 
 
426 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  46.14 
 
 
621 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  58.5 
 
 
427 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  56.97 
 
 
509 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  51.73 
 
 
774 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  61.39 
 
 
474 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  42.92 
 
 
456 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  42.92 
 
 
456 aa  362  8e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  45.22 
 
 
445 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  46.76 
 
 
465 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  47.78 
 
 
450 aa  329  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  42.58 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  47.77 
 
 
449 aa  326  6e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  43.3 
 
 
450 aa  319  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  47.34 
 
 
424 aa  306  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  39.95 
 
 
432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  44.92 
 
 
424 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  39.73 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  42.01 
 
 
427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  31.62 
 
 
430 aa  133  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  28.31 
 
 
448 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  28.84 
 
 
387 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  24.62 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  24.62 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  25.16 
 
 
453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  28.71 
 
 
417 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  25.43 
 
 
411 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  26.4 
 
 
410 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  27.39 
 
 
366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  25.29 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  25.29 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  25.33 
 
 
457 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  25.58 
 
 
427 aa  110  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  24.35 
 
 
380 aa  106  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  28.92 
 
 
378 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  28.92 
 
 
378 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  28.22 
 
 
378 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  23.37 
 
 
407 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  30.38 
 
 
531 aa  89.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  22.32 
 
 
407 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  24.38 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  24.65 
 
 
410 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  28.42 
 
 
494 aa  84  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  24.24 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  25.4 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  31.76 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  28.43 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  22.49 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  29.06 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  25.5 
 
 
359 aa  77  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  28.74 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  24.01 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  25.42 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  22.08 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  22.42 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  23.33 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  22.98 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>