244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0082 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  89.49 
 
 		 409 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  77.45 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  77.47 
 
 		 405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  69.77 
 
 		 410 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  58.68 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  51.74 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  50.9 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  51.21 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  48.21 
 
 		 412 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  52.96 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  53.27 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  54.21 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  52.16 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  51.71 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  46.92 
 
 		 385 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  44.01 
 
 		 390 aa  318  7.999999999999999e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  42.99 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  44.38 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  44.19 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  40.73 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  37.96 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  37.7 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  36.98 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  36.49 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  35.62 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  36.42 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  35.36 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  38.16 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  38.16 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  36.83 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  34.98 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  35.47 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  36.3 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  31.18 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  28.98 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  26.49 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  27.24 
 
 		 448 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  30.57 
 
 		 441 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  21.79 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  25.68 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  25.48 
 
 		 514 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  28.83 
 
 		 495 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  25.91 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  29.18 
 
 		 495 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  25.16 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  26.52 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  29.82 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  26.57 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  27.61 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  21.67 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  29.39 
 
 		 518 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  27.41 
 
 		 494 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  28.26 
 
 		 492 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  27.3 
 
 		 455 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  28.32 
 
 		 451 aa  86.3  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  27.01 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  28.21 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  28.21 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  25.81 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  29 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  25.16 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  24.86 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  26.21 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  27.64 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  28.22 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  23.7 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  26.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  25.79 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  25.79 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  24.18 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  26.46 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  25.42 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  25.37 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  28.11 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.11 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  26.26 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  26.32 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  28.28 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  24.69 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  27.24 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  27.9 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  27.54 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  27.51 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  24.84 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  22.41 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  24.81 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1474  DNA recombination protein RmuC  24.25 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  27.47 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  22.93 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  27.11 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  26.34 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  23.82 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  26.34 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>