231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0817 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  100 
 
 
359 aa  699    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  46.05 
 
 
427 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  34.66 
 
 
430 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  32.78 
 
 
380 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  38.1 
 
 
448 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  34.25 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  32.49 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  31.91 
 
 
426 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  31.91 
 
 
439 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  33.33 
 
 
420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  33.33 
 
 
420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  31.99 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  27.95 
 
 
409 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  35.63 
 
 
378 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  35.22 
 
 
378 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  34.82 
 
 
378 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  30.55 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  27.4 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  27.4 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  33.33 
 
 
410 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  29.02 
 
 
407 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  29.67 
 
 
407 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  32.39 
 
 
405 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  27.88 
 
 
388 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  28.67 
 
 
405 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  33.2 
 
 
387 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  25.43 
 
 
410 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  28.95 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  30.74 
 
 
400 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  29.94 
 
 
390 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  30.35 
 
 
409 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  27.76 
 
 
399 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  26.26 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  27 
 
 
410 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  25.99 
 
 
385 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  33.68 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  27.31 
 
 
453 aa  87.4  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  24.09 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  23.63 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  23.77 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  21.8 
 
 
440 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  25 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  30.85 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000225596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  24.88 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  23.1 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  23.28 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  23.88 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  24.07 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  23.83 
 
 
479 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  26.76 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  24.49 
 
 
474 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  26.07 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1474  DNA recombination protein RmuC  29.79 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  24.91 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  24.39 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  22.65 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  25.17 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  26.94 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  22.45 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  25.59 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  21.09 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  23.04 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  24.54 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  26.94 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  26.52 
 
 
626 aa  67  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  25.54 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  25.31 
 
 
531 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  21.48 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  20.23 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  20.62 
 
 
531 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  23.14 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  23.34 
 
 
457 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  24.48 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  25.74 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  22.13 
 
 
490 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  21.79 
 
 
566 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  23.74 
 
 
508 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  28.57 
 
 
507 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  22.14 
 
 
466 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  24.87 
 
 
523 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  24.49 
 
 
495 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  26.3 
 
 
448 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  21.79 
 
 
566 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  28.83 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  26.37 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  24.49 
 
 
495 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  22.73 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  21.14 
 
 
456 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  25.58 
 
 
433 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  24.58 
 
 
459 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  25.13 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  20.86 
 
 
456 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  26.82 
 
 
504 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  29.13 
 
 
428 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  22.83 
 
 
490 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  24.6 
 
 
495 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  28.07 
 
 
498 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  22.55 
 
 
554 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  24.54 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>