234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0418 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  833    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  69.34 
 
 
409 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  70.32 
 
 
407 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  70.07 
 
 
407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  68.09 
 
 
407 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  68.28 
 
 
407 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  62.77 
 
 
412 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  63.43 
 
 
390 aa  463  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  67.7 
 
 
399 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  55.56 
 
 
405 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  54.08 
 
 
400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  54.08 
 
 
405 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  55.03 
 
 
409 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  46.87 
 
 
410 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  47.06 
 
 
385 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  49.15 
 
 
388 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  49.56 
 
 
410 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  48.93 
 
 
366 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  42.52 
 
 
392 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  40.73 
 
 
411 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  38.9 
 
 
410 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  43.27 
 
 
378 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  39.16 
 
 
378 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  38.9 
 
 
378 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  41.35 
 
 
430 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  38.23 
 
 
380 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  38.56 
 
 
426 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  38.56 
 
 
439 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  41.99 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  38.48 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  40.69 
 
 
417 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  38.68 
 
 
420 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  38.68 
 
 
420 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  37.3 
 
 
457 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  31.07 
 
 
427 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  28.13 
 
 
359 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  31.29 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  24.52 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  28.52 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  25.65 
 
 
412 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  25.99 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  31.78 
 
 
518 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  29.69 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  23.01 
 
 
432 aa  89.7  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  25.49 
 
 
450 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  27.46 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  27.82 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  27.61 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  25.44 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  27.41 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  25.94 
 
 
774 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  29 
 
 
508 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  25.65 
 
 
514 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  26.84 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  26.42 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  27.86 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  28.24 
 
 
495 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  24.16 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  24.43 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  26.41 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  24.29 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  24.29 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  27.82 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  29.61 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  29.62 
 
 
504 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  24.86 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  28.38 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  26.5 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  23.93 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  28.24 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  24.77 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  25.98 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  27.95 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  29.15 
 
 
433 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  27.13 
 
 
491 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  27.13 
 
 
491 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  27.13 
 
 
491 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  27.13 
 
 
491 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  23.86 
 
 
424 aa  76.3  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  27.91 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  27.13 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  27.87 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  25.07 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  27 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  26.62 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  27.13 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  27.13 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  24.29 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  26.44 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  24.78 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  25.69 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  27.65 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  25.87 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  25.87 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  25.26 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  23.19 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  24.4 
 
 
566 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  26.48 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  24.53 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  25.81 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>