228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0070 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  93.37 
 
 		 407 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 407 aa  820    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  71.5 
 
 		 412 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  64.59 
 
 		 409 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  73.71 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  64.34 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  63.09 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  70.47 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  55.98 
 
 		 390 aa  435  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  52.65 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  50.58 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  54.15 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  54.78 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  53.48 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  49.3 
 
 		 410 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  49.72 
 
 		 385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  48.99 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  46.43 
 
 		 366 aa  290  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  44.44 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  42.9 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  41.1 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  41.59 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  39.66 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  39.39 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  41.14 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  37.54 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  37.57 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  37.54 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  39.53 
 
 		 380 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  38.46 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  38.1 
 
 		 420 aa  226  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  38.1 
 
 		 420 aa  225  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  38.1 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  36.96 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  30.31 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  29.02 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  28.41 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  27.4 
 
 		 488 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  24.21 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  29.67 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  25.6 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  25.78 
 
 		 514 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  25 
 
 		 450 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  31.51 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  27.1 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  27.92 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  26.02 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  28.63 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  27.55 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  27.55 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  26.3 
 
 		 479 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  24.09 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  29.97 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  25.85 
 
 		 518 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  27.42 
 
 		 450 aa  86.3  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  27.03 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  27.75 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  28.78 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  27.92 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  26.48 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  25.08 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  28.49 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  28.22 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  25.07 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  22.63 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  25.28 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  28.36 
 
 		 774 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  26.8 
 
 		 495 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  26.89 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  26.29 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  23.28 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  25.52 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  26.56 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  23.28 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  23.28 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  28.91 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  27.24 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  22.99 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  25.63 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  27.27 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  27.44 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  22.99 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  22.99 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  22.99 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  23.37 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  25.75 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  25.5 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  25.18 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  25.93 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  24.71 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  24.63 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  25.91 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  24.47 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  20.95 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  25.51 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  28.8 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  24.18 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  24.8 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  25.99 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>