211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0614 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0614  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  684    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  24.66 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  23.81 
 
 
417 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  26.23 
 
 
457 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0817  protein of unknown function DUF195  33.79 
 
 
359 aa  123  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  27.39 
 
 
426 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  27.39 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  21.88 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  31.01 
 
 
427 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  25.9 
 
 
448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  22.13 
 
 
378 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  26.42 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  21.86 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  25.08 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  23.15 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  24.21 
 
 
366 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  27.27 
 
 
411 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  24.91 
 
 
409 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  24.56 
 
 
407 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  24.84 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  24.56 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  25.51 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  24.21 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  23.18 
 
 
412 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  21.71 
 
 
400 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  22.76 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  20.57 
 
 
409 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  22.26 
 
 
410 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1318  RmuC domain-containing protein  24.22 
 
 
390 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  22.63 
 
 
410 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  22.92 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  21.67 
 
 
405 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0279  protein of unknown function DUF195  19.09 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0843742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0053  hypothetical protein  23.1 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720578  hitchhiker  0.0000240379 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  25 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  21.26 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  26.81 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  22.4 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  20.72 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  25.7 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  26.09 
 
 
495 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  26.09 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  25.72 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  28.05 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  22.03 
 
 
440 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  21.57 
 
 
438 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  22.92 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  22.3 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  27.6 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  20.2 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  23.93 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  20.56 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  25.21 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  22.31 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  24.58 
 
 
492 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  25.21 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  23.49 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  23.51 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  24.5 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  26.16 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  22.66 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  23.19 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  25.89 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  21.24 
 
 
466 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  21.45 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  23.32 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  19.86 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  21.45 
 
 
495 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  20.63 
 
 
518 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  22.15 
 
 
514 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  21.54 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  19.83 
 
 
566 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  22.27 
 
 
488 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  20.99 
 
 
448 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  21.38 
 
 
444 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  19.56 
 
 
566 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  26.58 
 
 
491 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  24.19 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  21.85 
 
 
445 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  22.57 
 
 
490 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  20.5 
 
 
491 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  20.5 
 
 
491 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  21 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  20.99 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  21.57 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  20.77 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  20.31 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  18.03 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  21.46 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  20.77 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  20.77 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  26.55 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  20.5 
 
 
774 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  20.34 
 
 
445 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  22.83 
 
 
402 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  18.82 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  22.71 
 
 
554 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  19.86 
 
 
427 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>