232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0965 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  92.78 
 
 		 457 aa  829    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  77.41 
 
 		 488 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  97.34 
 
 		 490 aa  867    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 490 aa  984    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  73.72 
 
 		 495 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  71.72 
 
 		 494 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  73.26 
 
 		 495 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  72.05 
 
 		 491 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  72.05 
 
 		 491 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  72.95 
 
 		 492 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  74.12 
 
 		 492 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  72.27 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  73.44 
 
 		 491 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  70.68 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  68.39 
 
 		 481 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  68.76 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  64.29 
 
 		 448 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  62.25 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  55.47 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  54.41 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  56.18 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  55.91 
 
 		 441 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  54.1 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  52.52 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  64.53 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  53.42 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  56.97 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  48.79 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  57.45 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  53.4 
 
 		 774 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  48.54 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  49.57 
 
 		 508 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  58.81 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  58.52 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  47 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  56.08 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  58.05 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  46.42 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  46.42 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  52.69 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  58.84 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  53.71 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  52.79 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  62.66 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  56.95 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  45.76 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  43.72 
 
 		 465 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  42.38 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  48.43 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  43.79 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  48.82 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  42.49 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  40.7 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  39.22 
 
 		 451 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  38.24 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2949  protein of unknown function DUF195  40.06 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.173006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1874  hypothetical protein  26.5 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  24.72 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0770  hypothetical protein  33 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33897  normal  0.0446881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1261  hypothetical protein  27.7 
 
 		 448 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.263937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2464  protein of unknown function DUF195  29.17 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0853612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0103  hypothetical protein  26.74 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0733  protein of unknown function DUF195  25.71 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390506  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1094  hypothetical protein  27.05 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2757  hypothetical protein  27.3 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2934  hypothetical protein  27.05 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.323227  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4048  hypothetical protein  30.6 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1017  hypothetical protein  25.13 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0984  hypothetical protein  24.93 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1368  RmuC family protein  24.11 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000211389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3589  hypothetical protein  26.13 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1309  RmuC family protein  24.11 
 
 		 439 aa  107  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000109458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0260  hypothetical protein  26.82 
 
 		 366 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0364  protein of unknown function DUF195  29.32 
 
 		 410 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.659068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0672  hypothetical protein  27.04 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0082  hypothetical protein  24.84 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3251  hypothetical protein  26.22 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3348  hypothetical protein  24.13 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0070  protein of unknown function DUF195  27.24 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0624  protein of unknown function DUF195  24.74 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  27.6 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7338  hypothetical protein  24.42 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0802  hypothetical protein  24.29 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0466  hypothetical protein  22.16 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0054  protein of unknown function DUF195  26.41 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0396874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1343  hypothetical protein  23.34 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.47326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  28.88 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0418  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  26.69 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  25.81 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0977  hypothetical protein  23.12 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  27.54 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1036  hypothetical protein  23.05 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3306  hypothetical protein  27.91 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884228  normal  0.913544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>