More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2415 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2415  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
218 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3109  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.01 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  38.01 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.21 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1253  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.02 
 
 
212 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.269773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1657  uracil-DNA glycosylase family protein  35.11 
 
 
213 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1412  uracil-DNA glycosylase family protein; DNA polymerase  35.11 
 
 
213 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.064172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1585  uracil-DNA glycosylase family protein  34.78 
 
 
213 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1696  uracil-DNA glycosylase family protein  35.11 
 
 
213 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0876972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1439  uracil-DNA glycosylase family protein  35.11 
 
 
213 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000235617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1411  uracil-DNA glycosylase family protein; DNA polymerase  35.11 
 
 
213 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1552  uracil-DNA glycosylase family protein  35.11 
 
 
213 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0493484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1623  uracil-DNA glycosylase family protein  35.11 
 
 
213 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.27237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1455  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  34.57 
 
 
216 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1040  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.41 
 
 
194 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000181922  unclonable  0.00000862933 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  35.84 
 
 
210 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.73 
 
 
209 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3760  uracil-DNA glycosylase family protein  33.7 
 
 
213 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.48 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.68 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  33.71 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.71 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.9 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  34.88 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1526  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.77 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.88 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.88 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.81 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.83 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.49 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  32.2 
 
 
233 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.83 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.02 
 
 
193 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.83 
 
 
196 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.02 
 
 
205 aa  92  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
199 aa  92  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.06 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.44 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.09 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.93 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.57 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  33.59 
 
 
492 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.95 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.57 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  33.13 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
209 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.34 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0792  Uracil-DNA glycosylase  31.02 
 
 
211 aa  89  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000269712  hitchhiker  1.0015500000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.46 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.51 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.39 
 
 
484 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  31.33 
 
 
218 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.89 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  31.33 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1556  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.01 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.199846  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.29 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  32.73 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.52 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.13 
 
 
484 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  31.33 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.24 
 
 
276 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.91 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.82 
 
 
290 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.82 
 
 
200 aa  85.1  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.23 
 
 
249 aa  84.7  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.12 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.67 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1809  DNA polymerase  36.54 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0231  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.25 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0104568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.82 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.07 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1351  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.91 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.33 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.96 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.04 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.19 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  31.64 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.4 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.11 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.63 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.07 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.03 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.82 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.97 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.21 
 
 
491 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  31.71 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.92 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.89 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.1 
 
 
490 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.48 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.77 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.86 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.83 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>