More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1526 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1526  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
217 aa  446  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0792  Uracil-DNA glycosylase  54.19 
 
 
211 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000269712  hitchhiker  1.0015500000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1253  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.19 
 
 
212 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.269773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1657  uracil-DNA glycosylase family protein  45.02 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1455  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.17 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1439  uracil-DNA glycosylase family protein  45.97 
 
 
213 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000235617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1552  uracil-DNA glycosylase family protein  45.97 
 
 
213 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0493484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1623  uracil-DNA glycosylase family protein  45.97 
 
 
213 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.27237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3760  uracil-DNA glycosylase family protein  45.85 
 
 
213 aa  187  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1411  uracil-DNA glycosylase family protein; DNA polymerase  45.97 
 
 
213 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1412  uracil-DNA glycosylase family protein; DNA polymerase  45.28 
 
 
213 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.064172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1585  uracil-DNA glycosylase family protein  44.66 
 
 
213 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1696  uracil-DNA glycosylase family protein  45.5 
 
 
213 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0876972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.29 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.7 
 
 
210 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.69 
 
 
191 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.51 
 
 
196 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  30.77 
 
 
195 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.02 
 
 
206 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  34.97 
 
 
206 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  33.88 
 
 
189 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.84 
 
 
187 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.93 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.64 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  29.11 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.12 
 
 
254 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.06 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.03 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.8 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.76 
 
 
546 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2415  Uracil-DNA glycosylase superfamily  30.77 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.96 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.71 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  35.03 
 
 
275 aa  92  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.74 
 
 
190 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.77 
 
 
195 aa  92  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.84 
 
 
200 aa  91.7  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3109  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.67 
 
 
192 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.43 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  29.79 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.78 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.65 
 
 
285 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  32.28 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.91 
 
 
277 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.58 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.79 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
380 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.73 
 
 
221 aa  89  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.98 
 
 
242 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.78 
 
 
216 aa  89  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.87 
 
 
192 aa  89  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  37.04 
 
 
255 aa  89  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.49 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.15 
 
 
193 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.21 
 
 
305 aa  88.6  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.76 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  38.28 
 
 
261 aa  87.4  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0873  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.89 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.36 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.95 
 
 
217 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.69 
 
 
194 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.73 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.73 
 
 
295 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.18 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 
341 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.69 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.134405  normal  0.334505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.06 
 
 
217 aa  87  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.95 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.11 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.76 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.54 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
253 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.04 
 
 
281 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.63 
 
 
277 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.67 
 
 
289 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.96 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.8 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  36.59 
 
 
261 aa  85.1  8e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.86 
 
 
290 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2659  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.81 
 
 
285 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.35 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.53 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.87 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.63 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.81 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.81 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.36 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.39 
 
 
301 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.86 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  31.33 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.74 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.36 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.79 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.36 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.06 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.5 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.09 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.09 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>