More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1040 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1040  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
194 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000181922  unclonable  0.00000862933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.41 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3109  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.46 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  39.89 
 
 
218 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  39.89 
 
 
218 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  39.89 
 
 
218 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.94 
 
 
193 aa  104  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.72 
 
 
190 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.57 
 
 
209 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.07 
 
 
194 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2415  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.41 
 
 
218 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.53 
 
 
206 aa  99  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.43 
 
 
191 aa  99  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.41 
 
 
210 aa  99  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.36 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.42 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  36.53 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
216 aa  97.8  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.62 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.86 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.89 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  35.97 
 
 
233 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.03 
 
 
304 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.27 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.27 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.84 
 
 
327 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.41 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.52 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.27 
 
 
217 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.95 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  38.13 
 
 
292 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.01 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  39.33 
 
 
213 aa  92  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.94 
 
 
221 aa  92  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.25 
 
 
264 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.25 
 
 
264 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.71 
 
 
285 aa  90.9  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.01 
 
 
187 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.59 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  38.6 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  39.85 
 
 
224 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.16 
 
 
281 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  39.86 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.52 
 
 
271 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.95 
 
 
315 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.34 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.91 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.96 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.13 
 
 
476 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  40.48 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.57 
 
 
317 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.42 
 
 
260 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
224 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.98 
 
 
219 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.19 
 
 
209 aa  89  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.85 
 
 
263 aa  88.6  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.94 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.27 
 
 
264 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
224 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.59 
 
 
231 aa  88.2  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.69 
 
 
290 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.89 
 
 
216 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.92 
 
 
245 aa  87.8  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.27 
 
 
244 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.48 
 
 
225 aa  87.8  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.42 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1085  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.43 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.307792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.42 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
330 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.23 
 
 
224 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.63 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.67 
 
 
273 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.22 
 
 
217 aa  87  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.04 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.43 
 
 
341 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.81 
 
 
305 aa  85.9  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.92 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
245 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.97 
 
 
358 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
290 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
290 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0551  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
324 aa  85.1  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0957804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.69 
 
 
401 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.69 
 
 
414 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.48 
 
 
264 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.35 
 
 
490 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  35.57 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.71 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
264 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.1 
 
 
345 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.4 
 
 
211 aa  84.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.4 
 
 
294 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.87 
 
 
367 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
205 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
295 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.8 
 
 
297 aa  84.7  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>