More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0608 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 393 aa  781    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  93.33 
 
 		 401 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  89.42 
 
 		 226 aa  339  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  80.98 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  79.66 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  82.97 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  79.37 
 
 		 403 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  78.03 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  69.11 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  69.35 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  68.54 
 
 		 235 aa  279  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  71.91 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  74.57 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  73.41 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  72.47 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  66.14 
 
 		 230 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  70.52 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  68.79 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  60.34 
 
 		 228 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  60.45 
 
 		 172 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  59.89 
 
 		 230 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  54.7 
 
 		 230 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.3 
 
 		 231 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 230 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  50 
 
 		 230 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 230 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 231 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.89 
 
 		 234 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  50 
 
 		 234 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.89 
 
 		 234 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 231 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  50.53 
 
 		 230 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  50 
 
 		 234 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  50 
 
 		 232 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  50 
 
 		 234 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  50 
 
 		 234 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  50 
 
 		 232 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  50 
 
 		 234 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  50 
 
 		 234 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  49.72 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 232 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  50 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  49.45 
 
 		 232 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 228 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 232 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  50.28 
 
 		 229 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 232 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  50.8 
 
 		 235 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  51.67 
 
 		 234 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.16 
 
 		 209 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  49.45 
 
 		 232 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  49.45 
 
 		 232 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.16 
 
 		 209 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.16 
 
 		 209 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 229 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 232 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 232 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 232 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.74 
 
 		 225 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 232 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  49.48 
 
 		 236 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 228 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.31 
 
 		 235 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 		 228 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  48.53 
 
 		 241 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  51.34 
 
 		 230 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.21 
 
 		 225 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  49.75 
 
 		 230 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.21 
 
 		 230 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.21 
 
 		 225 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  49.21 
 
 		 231 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.21 
 
 		 225 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.77 
 
 		 235 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.12 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.34 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.21 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.34 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.34 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.87 
 
 		 225 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  49.44 
 
 		 231 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.34 
 
 		 225 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  50.53 
 
 		 231 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  46.81 
 
 		 225 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 247 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  46.81 
 
 		 225 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  50.53 
 
 		 231 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.81 
 
 		 225 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  50.53 
 
 		 231 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 245 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  50.27 
 
 		 226 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.81 
 
 		 226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  47.31 
 
 		 231 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  51.12 
 
 		 232 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  44.97 
 
 		 227 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.44 
 
 		 231 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  47.85 
 
 		 234 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>