20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0193 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  77.2 
 
 		 396 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  75.7 
 
 		 396 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  812    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  78.99 
 
 		 396 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  83.51 
 
 		 403 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  82.99 
 
 		 403 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  83.25 
 
 		 401 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  72.54 
 
 		 398 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  76.05 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  76.7 
 
 		 398 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  75.85 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  74.54 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  73.25 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  73.82 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  53.68 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  80.98 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  74.42 
 
 		 235 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  77.56 
 
 		 167 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  68.59 
 
 		 172 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  28.1 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>