18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4145 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  87.28 
 
 
397 aa  320  9.000000000000001e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  83.82 
 
 
398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  84.39 
 
 
397 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  84.39 
 
 
402 aa  311  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  84.3 
 
 
397 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  83.72 
 
 
398 aa  309  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  77.33 
 
 
396 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  76.88 
 
 
396 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  75.58 
 
 
396 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  74.56 
 
 
403 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  74.42 
 
 
398 aa  271  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  73.96 
 
 
403 aa  271  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  73.96 
 
 
401 aa  270  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  67.63 
 
 
398 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  76.43 
 
 
167 aa  252  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  54.91 
 
 
402 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  28.48 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>