More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6231 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6231  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
333 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.08 
 
 
333 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  0.208891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  60.62 
 
 
326 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26780  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  56.13 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.78 
 
 
330 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.5364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5134  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.99 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4448  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.49 
 
 
324 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00527977  normal  0.14631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10070  putative zinc-dependent oxidoreductase  41.21 
 
 
328 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475376  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0930  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.18 
 
 
328 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0155  zinc-binding dehydrogenase  36.59 
 
 
327 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1971  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.36 
 
 
328 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18380  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.11 
 
 
327 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.23 
 
 
323 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0174615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.15 
 
 
328 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
339 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.12 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.31 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.17 
 
 
336 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
302 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.53 
 
 
336 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.31 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.48 
 
 
332 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.42 
 
 
327 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
329 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
333 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  31.63 
 
 
329 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.21 
 
 
326 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.51 
 
 
350 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.89 
 
 
336 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
321 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
328 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 
328 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.55 
 
 
323 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.23 
 
 
329 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.16 
 
 
341 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.2 
 
 
335 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.86 
 
 
321 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.33 
 
 
335 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
333 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
332 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.88 
 
 
334 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  29.82 
 
 
360 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  29.79 
 
 
325 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 
310 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
322 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.09 
 
 
324 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05290  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
391 aa  100  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.34 
 
 
325 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.55 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.65 
 
 
326 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  29.08 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.16 
 
 
327 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.07 
 
 
346 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0488  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  28.24 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.49 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.7 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.63 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.53 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
319 aa  96.3  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.82 
 
 
338 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.42 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  28.75 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0872  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
302 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.96562 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  27.3 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
327 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  30.21 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  29.04 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.33 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.7 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  29.46 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4143  alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00967604  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.81 
 
 
323 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
320 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.91 
 
 
328 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.61 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.39 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
326 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.14 
 
 
342 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.18 
 
 
332 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.83 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  26.79 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>