More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5453 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
333 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  0.208891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6231  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.08 
 
 
333 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  64.74 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26780  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  57.85 
 
 
327 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.56 
 
 
330 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.5364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5134  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50 
 
 
344 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4448  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.58 
 
 
324 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00527977  normal  0.14631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10070  putative zinc-dependent oxidoreductase  40.61 
 
 
328 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475376  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0930  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.7 
 
 
328 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0155  zinc-binding dehydrogenase  37.5 
 
 
327 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1971  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.36 
 
 
328 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18380  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  36.9 
 
 
327 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 
323 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0174615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.47 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.87 
 
 
326 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 
329 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
329 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
326 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
360 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.29 
 
 
328 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
339 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.75 
 
 
333 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.79 
 
 
332 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 
322 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  31.25 
 
 
329 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
302 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.41 
 
 
342 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.03 
 
 
327 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
328 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.91 
 
 
320 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.86 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.63 
 
 
332 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.59 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.11 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.7 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.89 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  35.37 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  30.47 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.89 
 
 
338 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.45 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  29.17 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.53 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  30.59 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.35 
 
 
334 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.94 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.21 
 
 
324 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
329 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.12 
 
 
335 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.51 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.53 
 
 
342 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.57 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.88 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 
317 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0488  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.8 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.32 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.5 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
339 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
327 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
327 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 
327 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  27.86 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.24 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05290  conserved hypothetical protein  26 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.76 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.69 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3096  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.54 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.751832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.35 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.11 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.06 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.67 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.06 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.13 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.76 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.59 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4084  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
325 aa  89  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.48 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
329 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>