46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00380 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH00380  integral to membrane protein, putative  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.725302  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10630  hypothetical protein  39.11 
 
 
279 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0581232  normal  0.286938 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04932  haemolysin-III channel protein Izh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10570)  38.6 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_5299  predicted protein  31.84 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0808699  normal  0.0652412 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51237  hemolysin III domain membrane protein  32.29 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.915536  normal  0.0649475 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00100  endoplasmic reticulum protein, putative  30.74 
 
 
662 aa  85.9  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0390178  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05151  IZH family channel protein (Izh3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07160)  29.71 
 
 
498 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526862  normal  0.490233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  28.72 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  29.63 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  27.66 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  26.7 
 
 
195 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  26.18 
 
 
195 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  28.09 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  30.81 
 
 
214 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  28.89 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  26.74 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  28.64 
 
 
224 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  28.74 
 
 
250 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  29.94 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  27.32 
 
 
216 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  25.4 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  28.27 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  26.92 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  26.78 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  25.7 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  33.57 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  28.72 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  25.4 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  27.32 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  28.19 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  26.37 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  26.47 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  29.48 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  26.7 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  26.14 
 
 
221 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  24.87 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  26.67 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  24.02 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  25.27 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  24.71 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  24.71 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  24.71 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  25.65 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  26.29 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  25.68 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  26.58 
 
 
217 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>