More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1327 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1327  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
288 aa  578  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1221  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.88 
 
 
288 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1340  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.88 
 
 
288 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.903625  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0499  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.43 
 
 
289 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0522  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.49 
 
 
288 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1395  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.28 
 
 
288 aa  420  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1312  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.2 
 
 
288 aa  408  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.302552  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1211  signal recognition particle-docking GTPase FtsY  67.94 
 
 
288 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0881  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.1 
 
 
294 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0843  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  55.14 
 
 
292 aa  301  6.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.49 
 
 
320 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  43.83 
 
 
311 aa  239  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.31 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.81 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.71 
 
 
317 aa  232  5e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.85 
 
 
478 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.85 
 
 
477 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0366  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.36 
 
 
294 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0348  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.36 
 
 
294 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.09 
 
 
416 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.09 
 
 
416 aa  229  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  41.08 
 
 
408 aa  228  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.67 
 
 
405 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.23 
 
 
447 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  42 
 
 
320 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  43.63 
 
 
317 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 
317 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.42 
 
 
330 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 
397 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.7 
 
 
320 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  43.23 
 
 
355 aa  225  8e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.9 
 
 
317 aa  225  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 
413 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.11 
 
 
432 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0727  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.66 
 
 
536 aa  224  9e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  42.9 
 
 
355 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.72 
 
 
373 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.67 
 
 
320 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1399  signal recognition particle receptor (docking protein)  44.81 
 
 
463 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  43.75 
 
 
541 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  52.11 
 
 
410 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.23 
 
 
310 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  43.19 
 
 
317 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.56 
 
 
329 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.2 
 
 
387 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.77 
 
 
320 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.52 
 
 
453 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0390  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.08 
 
 
524 aa  222  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.85 
 
 
375 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  49.33 
 
 
563 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  53.05 
 
 
408 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.85 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.08 
 
 
315 aa  222  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.33 
 
 
326 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 
452 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.49 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.47 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  54 
 
 
535 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.48 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.57 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.19 
 
 
485 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  46.05 
 
 
510 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.08 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  40.13 
 
 
350 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.39 
 
 
501 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.74 
 
 
377 aa  219  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.08 
 
 
376 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  50 
 
 
541 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  50 
 
 
553 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.78 
 
 
347 aa  218  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
523 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.28 
 
 
643 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.28 
 
 
561 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.05 
 
 
487 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.07 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.13 
 
 
329 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.61 
 
 
584 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  46.04 
 
 
471 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  46.93 
 
 
472 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  44.91 
 
 
495 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  52 
 
 
498 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  52 
 
 
497 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
497 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  52 
 
 
498 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  52 
 
 
498 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
491 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  52.11 
 
 
407 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.86 
 
 
346 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  52 
 
 
498 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  52 
 
 
512 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.23 
 
 
329 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.13 
 
 
329 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
491 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.87 
 
 
508 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
491 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.61 
 
 
582 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 
587 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  52 
 
 
498 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
491 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>