52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0042 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0042  type II secretion system protein  100 
 
 
284 aa  577  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0129  replicative DNA helicase  26.6 
 
 
485 aa  55.8  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  26.87 
 
 
450 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4469  replicative DNA helicase  25.45 
 
 
499 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  25.47 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0107  replicative DNA helicase  23.89 
 
 
442 aa  50.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.598897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  25 
 
 
462 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  25.2 
 
 
447 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  21.57 
 
 
470 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  25.56 
 
 
444 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  24.89 
 
 
469 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1377  DnaB domain protein helicase domain protein  24.3 
 
 
437 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0470845  hitchhiker  0.00000000022728 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  22.09 
 
 
473 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  26.42 
 
 
461 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  25.11 
 
 
454 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  22.76 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  26.1 
 
 
460 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  23.27 
 
 
457 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf761  bacteriophage MAV1 replication protein RepB  28.36 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  23.11 
 
 
456 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  24.77 
 
 
456 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  25.11 
 
 
454 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0637  replicative DNA helicase  26.32 
 
 
436 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0562  replicative DNA helicase  26.32 
 
 
440 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.229469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  25.29 
 
 
444 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3611  replicative DNA helicase  27.02 
 
 
440 aa  45.8  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  23.85 
 
 
442 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  23.08 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  24.17 
 
 
449 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  24.62 
 
 
447 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  23.81 
 
 
446 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  25.66 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  25.78 
 
 
451 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  24.17 
 
 
449 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  23.38 
 
 
478 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  24.22 
 
 
456 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1358  replicative DNA helicase  26.48 
 
 
436 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0325  replicative DNA helicase  25.89 
 
 
465 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.405271  normal  0.564543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  22.88 
 
 
451 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  23.79 
 
 
446 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  22.88 
 
 
451 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  22.95 
 
 
481 aa  43.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  21.97 
 
 
509 aa  42.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  22.98 
 
 
446 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  23.38 
 
 
457 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4055  replicative DNA helicase  25 
 
 
504 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  24.06 
 
 
510 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  23.26 
 
 
479 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  34.83 
 
 
485 aa  42.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2289  replicative DNA helicase  25.22 
 
 
496 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  24.28 
 
 
449 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  25.41 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>