181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1200 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1200  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010126  normal  0.466724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5408  cation efflux protein  87.14 
 
 		 222 aa  351  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362512  normal  0.663662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  47.21 
 
 		 400 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  43.58 
 
 		 418 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  44.28 
 
 		 404 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  44.28 
 
 		 404 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  44.28 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  44.28 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  44.28 
 
 		 385 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  44.28 
 
 		 385 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  43.28 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  45.77 
 
 		 414 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  44.78 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  44.78 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  45.41 
 
 		 396 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  45.41 
 
 		 396 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  45.41 
 
 		 396 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  45.41 
 
 		 396 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  45.41 
 
 		 396 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  45.41 
 
 		 396 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  39.69 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  37.61 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  36.73 
 
 		 318 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 382 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  41.62 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  37.67 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  33.62 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 		 307 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 		 307 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  35.4 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  33.85 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  33.85 
 
 		 380 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  34.65 
 
 		 389 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 388 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.57 
 
 		 378 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 378 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  33.88 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4223  cation efflux protein  30.73 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  29.95 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.32 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  30.21 
 
 		 391 aa  72  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 391 aa  72  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  28.72 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  26.84 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.83 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.64 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  31.28 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  26.84 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  28.77 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.36 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.36 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  27.14 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  26.89 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  26.5 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  32.83 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  24.88 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  27.98 
 
 		 376 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 389 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.12 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  25.26 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37588  mitochondrial protein with role in iron accumulation  35.48 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147499  normal  0.0229971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  31.28 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  27.64 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  31.28 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>