109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4946 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4946  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  329  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.771585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.07 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.41 
 
 		 241 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.1 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  31.65 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  30.56 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  31.65 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  29.86 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  29.86 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  29.86 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  29.86 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  29.53 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  30.72 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  34.59 
 
 		 249 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.89 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  28.76 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.35 
 
 		 246 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  25.37 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  27.74 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.67 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.14 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  28.05 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.12 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  27.12 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.9 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  29.27 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  29.27 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  30.07 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.13 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  31.87 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.03 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  32.17 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  24.67 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.14 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.08 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  26.03 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  27.08 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.3 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  29.13 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  30.34 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  21.31 
 
 		 245 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  29.45 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  21.13 
 
 		 246 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  28.48 
 
 		 268 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  31.85 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  33.78 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  25.9 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  28.83 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  24.17 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.86 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.44 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  27.93 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.32 
 
 		 251 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.65 
 
 		 245 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2967  protein-disulfide isomerase  32.22 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.03 
 
 		 241 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  25.52 
 
 		 269 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  22.4 
 
 		 246 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  30.69 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.36 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  26.04 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.77 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.03 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.03 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.03 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.03 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  20.77 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.64 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.77 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.22 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  29.69 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.54 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.4 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  23.02 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.77 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  20.77 
 
 		 236 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.19 
 
 		 246 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  20.77 
 
 		 236 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  30.59 
 
 		 371 aa  42.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.77 
 
 		 236 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.03 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.77 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.38 
 
 		 253 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.73 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  25.32 
 
 		 243 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.66 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.03 
 
 		 245 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2587  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0358064  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0081  hypothetical protein  27.16 
 
 		 235 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>