165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1150 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  70.77 
 
 		 268 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  39.5 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  39.17 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  40.67 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  41.8 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  42.04 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  33.95 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2587  hypothetical protein  43.85 
 
 		 179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0358064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0870  protein-disulfide isomerase  46.72 
 
 		 164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0861  protein-disulfide isomerase  44.44 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2967  protein-disulfide isomerase  42.34 
 
 		 159 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3385  protein-disulfide isomerase  42.34 
 
 		 167 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0933  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.430203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.65 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  31.1 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  31.47 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  24.59 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.22 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  28.91 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  26.16 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  27.83 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  31.4 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.58 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  26.92 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.55 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  27.55 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.34 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.16 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  31.3 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  24.75 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.31 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.13 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  32.5 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  25.21 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  24.89 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  26.53 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  28.29 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  26.53 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  26.53 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  26.53 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  24.88 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  28.17 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  26.75 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  28.17 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.67 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  27.37 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.59 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.52 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.05 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  29.13 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.64 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.37 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  29.02 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.61 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  27.57 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  27.16 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.51 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  30.3 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  27.02 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  27.31 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.14 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.32 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  27.12 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  25.93 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.12 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.12 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.12 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  25.23 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  25.31 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  25.17 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.6 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.07 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  26.69 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.65 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  26.69 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.27 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  26.16 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.69 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.6 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.69 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25.2 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.21 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.23 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.46 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  26.64 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.74 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>