134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0025 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  745    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  93.95 
 
 
347 aa  682    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  55.05 
 
 
371 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  34.75 
 
 
277 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  30.74 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  31.05 
 
 
285 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.82 
 
 
238 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.82 
 
 
238 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.82 
 
 
238 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.9 
 
 
253 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  31.29 
 
 
246 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.46 
 
 
236 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  33.9 
 
 
236 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36 
 
 
238 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  33.9 
 
 
236 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  33.9 
 
 
236 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.9 
 
 
236 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.29 
 
 
246 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  28.77 
 
 
243 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36 
 
 
238 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
247 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
247 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.06 
 
 
260 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.41 
 
 
238 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.21 
 
 
242 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.5 
 
 
239 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.64 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.64 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.64 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.67 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.64 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  28.18 
 
 
244 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.64 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.95 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  32.42 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.85 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.11 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.38 
 
 
237 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.89 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.38 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.03 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.27 
 
 
254 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.42 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.59 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  32.37 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.46 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.67 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.67 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.67 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.63 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.87 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.57 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.96 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.5 
 
 
240 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.34 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.5 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.44 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.44 
 
 
241 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.42 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.44 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.44 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.51 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  24.76 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  32.82 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  28.92 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  28.83 
 
 
244 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  29.02 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.37 
 
 
241 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  27.13 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25.29 
 
 
262 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  27.59 
 
 
178 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  25.54 
 
 
256 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  28.26 
 
 
272 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.06 
 
 
250 aa  62.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.26 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.78 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  34.94 
 
 
179 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  31.06 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  37.86 
 
 
236 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.14 
 
 
236 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  28.08 
 
 
242 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
242 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
242 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
242 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
242 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
242 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
245 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.6 
 
 
245 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  32.18 
 
 
239 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  28.08 
 
 
242 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.67 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  28.08 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  28.1 
 
 
242 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  31.43 
 
 
242 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  27.34 
 
 
187 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>