49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3395 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 
186 aa  386  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  97.33 
 
 
187 aa  373  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  84.95 
 
 
186 aa  328  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  85.03 
 
 
187 aa  324  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  85.03 
 
 
187 aa  324  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  85.03 
 
 
187 aa  324  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  85.03 
 
 
187 aa  324  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  85.03 
 
 
187 aa  324  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  85.03 
 
 
195 aa  324  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  84.49 
 
 
195 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  84.04 
 
 
187 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  84.04 
 
 
187 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  82.98 
 
 
187 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  82.98 
 
 
187 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  82.98 
 
 
187 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  82.54 
 
 
188 aa  317  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  80.32 
 
 
187 aa  308  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  94.7 
 
 
132 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  59.9 
 
 
203 aa  228  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  58 
 
 
207 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  57 
 
 
207 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  60.94 
 
 
198 aa  221  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  59.7 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  68.89 
 
 
141 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  71.76 
 
 
132 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  69.53 
 
 
139 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  66.15 
 
 
141 aa  198  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  66.15 
 
 
141 aa  198  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  65.62 
 
 
141 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  60 
 
 
159 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  68.99 
 
 
131 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  66.41 
 
 
187 aa  191  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  65.91 
 
 
192 aa  190  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  64.66 
 
 
182 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  62.41 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  63.28 
 
 
149 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  55.1  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  36.05 
 
 
137 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  35.11 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  35.29 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  33.72 
 
 
121 aa  48.5  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  32.47 
 
 
129 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1228  Barstar (barnase inhibitor)  33.98 
 
 
112 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  36.84 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0735  hypothetical protein  31.18 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>