48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5991 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 
141 aa  289  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  33.93 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  34.95 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  33.86 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  33.04 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  32.17 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  33.98 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  33.02 
 
 
203 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  33.64 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  33.64 
 
 
187 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  32.14 
 
 
198 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  31.53 
 
 
202 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  33.64 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  33.64 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  33.64 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  33.64 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  33.64 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  33.64 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  33.64 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  33.64 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  33.64 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  36.56 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  32.71 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  38.37 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  28.7 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  30.84 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  31.53 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  29.63 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  28.7 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  27.78 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  30.84 
 
 
187 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  27.78 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  32.71 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  29.84 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  30.23 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  28.7 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  27.78 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  26.61 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  31.86 
 
 
123 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  28.77 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3344  hypothetical protein  24.72 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  24.07 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  54.29 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>