46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3011 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  98.55 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  86.47 
 
 		 198 aa  362  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  68.08 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  66.67 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  58 
 
 		 186 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  59 
 
 		 187 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  58 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  58 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  57.56 
 
 		 195 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  58.5 
 
 		 188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  57.5 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  57.5 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  57.5 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  57.92 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  57.71 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  57.71 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  57.71 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  57.71 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  57.71 
 
 		 187 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  56 
 
 		 187 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  55.5 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  75.76 
 
 		 132 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  65.93 
 
 		 139 aa  194  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  63.7 
 
 		 141 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  68.75 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  63.7 
 
 		 141 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  63.7 
 
 		 141 aa  191  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  67.97 
 
 		 192 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  62.22 
 
 		 141 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  68.22 
 
 		 131 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  67.69 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  67.94 
 
 		 132 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  66.92 
 
 		 182 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  65.62 
 
 		 149 aa  184  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  64.06 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  32.35 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  32.95 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  28 
 
 		 123 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  32.26 
 
 		 121 aa  41.6  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>