54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00391 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  50.72 
 
 
137 aa  135  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  50.37 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  49.63 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  51.55 
 
 
121 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  32.65 
 
 
202 aa  67  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  31.82 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  32.73 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  33 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  33.33 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  32.35 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  28.23 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  32.08 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  33.65 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  33.65 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  31.73 
 
 
195 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  31.73 
 
 
187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  31.73 
 
 
195 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  31.73 
 
 
187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  31.73 
 
 
187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  31.73 
 
 
187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  31.73 
 
 
187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  36 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  33.67 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  29.63 
 
 
198 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  29 
 
 
207 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  32.65 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  31.68 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  28.83 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  30.84 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  44.62 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  29.81 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3344  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3333  hypothetical protein  32.65 
 
 
135 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1432  hypothetical protein  29.41 
 
 
126 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  45.24 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0735  hypothetical protein  31.25 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  35.19 
 
 
70 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3756  Barstar (barnase inhibitor)  25.53 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0122  YrdF  29.89 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000773419 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0152  YrdF  29.89 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.363111  hitchhiker  0.0000000066355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>