34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0947 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  275  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5433  hypothetical protein  46.07 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214095  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  31.31 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  34.72 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  46.38 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01230  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  50 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  44.93 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  34.02 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  37.14 
 
 
121 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  40.68 
 
 
207 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  38.98 
 
 
207 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  38.6 
 
 
203 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  35.59 
 
 
202 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  38.98 
 
 
198 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  36.84 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  31.25 
 
 
70 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  35.59 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3333  hypothetical protein  37.18 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  36.84 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  36.84 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  36.84 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  36.84 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  36.84 
 
 
187 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  36.84 
 
 
195 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  36.84 
 
 
195 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  36.84 
 
 
132 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  39.71 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  30.77 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  32.2 
 
 
139 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  35.59 
 
 
159 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>