11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01230  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5433  hypothetical protein  37.36 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214095  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  32.91 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0657  hypothetical protein  29.85 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.60843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  31.94 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  30.48 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  28.71 
 
 		 141 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>