47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3914 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  87.79 
 
 		 132 aa  235  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  71.09 
 
 		 159 aa  200  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  70.54 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  70.54 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  71.88 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  71.09 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  68.99 
 
 		 187 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  68.99 
 
 		 186 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  69.77 
 
 		 198 aa  191  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  67.97 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  68.99 
 
 		 186 aa  190  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  69.53 
 
 		 187 aa  190  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  68.99 
 
 		 207 aa  189  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  66.41 
 
 		 192 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  68.75 
 
 		 149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  68.22 
 
 		 207 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  67.44 
 
 		 195 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  67.44 
 
 		 132 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  67.44 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  67.44 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  67.44 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  67.44 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  67.44 
 
 		 195 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  67.44 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  66.67 
 
 		 187 aa  186  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  66.67 
 
 		 187 aa  186  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  186  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  66.67 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  66.67 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  66.67 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  66.67 
 
 		 203 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  65.12 
 
 		 187 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  65.12 
 
 		 202 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  62.02 
 
 		 182 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  59.69 
 
 		 206 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  28.83 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  28.35 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  30.3 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0735  hypothetical protein  29.91 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  46.34 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0859  Barstar (barnase inhibitor)  30.48 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  34.18 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01230  hypothetical protein  30.48 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  28.3 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  53.12 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  25.2 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>