46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2765 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  86.96 
 
 		 207 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  86.47 
 
 		 207 aa  362  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  70.1 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  70.1 
 
 		 202 aa  267  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  60.21 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  60.21 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  61.46 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  60.51 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  60.21 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  60.94 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  59.69 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  59.69 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  59.69 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  60.62 
 
 		 195 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  60.42 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  60.42 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  60.42 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  60.42 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  60.42 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  58.85 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  58.12 
 
 		 187 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  76.52 
 
 		 132 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  70.31 
 
 		 159 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  65.93 
 
 		 139 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  64.44 
 
 		 141 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  64.44 
 
 		 141 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  70 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  69.23 
 
 		 182 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  64.44 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  69.77 
 
 		 131 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  69.47 
 
 		 132 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  67.97 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  62.96 
 
 		 141 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  66.41 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  64.84 
 
 		 149 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  29.92 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  29.63 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  29.13 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  30.25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  32.98 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  32.35 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  37.5 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  38.98 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  32.95 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  35.11 
 
 		 121 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>