48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4761 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  290  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  86.23 
 
 
141 aa  254  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  86.23 
 
 
141 aa  254  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  84.06 
 
 
187 aa  246  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  81.88 
 
 
141 aa  241  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  84.5 
 
 
159 aa  237  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  82.35 
 
 
149 aa  234  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  77.54 
 
 
141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  76.81 
 
 
192 aa  231  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  75.19 
 
 
132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  69.53 
 
 
186 aa  199  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  71.88 
 
 
131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  68.75 
 
 
187 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  68.8 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  65.93 
 
 
198 aa  194  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  65.93 
 
 
207 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  68.8 
 
 
195 aa  193  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  68.8 
 
 
187 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  68.8 
 
 
195 aa  193  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  68.8 
 
 
187 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  68.8 
 
 
187 aa  193  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  68.8 
 
 
187 aa  193  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  68.8 
 
 
187 aa  193  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  65.19 
 
 
207 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  68.8 
 
 
132 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  67.2 
 
 
188 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  67.2 
 
 
187 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  67.2 
 
 
187 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  67.2 
 
 
187 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  67.2 
 
 
187 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  67.2 
 
 
187 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  65.38 
 
 
203 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  65.6 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  64.62 
 
 
202 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  60.94 
 
 
206 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  61.72 
 
 
182 aa  166  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  31.34 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  31.48 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  32.09 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  29.59 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  56.25 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  31.63 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0735  hypothetical protein  27.03 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  38.78 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  29.67 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0859  Barstar (barnase inhibitor)  27.93 
 
 
118 aa  40.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  32.2 
 
 
143 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>