51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2671 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  50.72 
 
 
141 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  42.75 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  40.88 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  52.81 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  24.39 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  30.3 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  34.95 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  35.96 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  28.68 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  29.92 
 
 
192 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  34.41 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  31.93 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  36.84 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  30.25 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  36.05 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  28.68 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  30.25 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  28.57 
 
 
207 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  34.48 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  34.48 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  28.57 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  35.71 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  35.63 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  34.48 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  35.63 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  35.63 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  35.63 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  34.48 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  34.48 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  35.63 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  35.63 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  35.63 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  35.63 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  34.88 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  34.48 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  34.48 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  29.41 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  28.35 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  51.22 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0320  hypothetical protein  31.33 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.077758  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1056  hypothetical protein  33.67 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  28.35 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5433  hypothetical protein  34.65 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214095  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  26.05 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  39.71 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3333  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>