46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5272 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 		 159 aa  332  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  81.69 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  81.69 
 
 		 141 aa  244  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  86.05 
 
 		 141 aa  241  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  84.5 
 
 		 139 aa  237  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  80.92 
 
 		 141 aa  235  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  73.83 
 
 		 187 aa  235  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  80.74 
 
 		 149 aa  233  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  64.2 
 
 		 192 aa  217  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  74.62 
 
 		 132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  71.09 
 
 		 131 aa  200  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  70.31 
 
 		 198 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  60 
 
 		 186 aa  193  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  63.83 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  63.83 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  63.83 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  63.83 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  63.83 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  67.19 
 
 		 186 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  63.19 
 
 		 187 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  63.83 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  68.75 
 
 		 207 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  63.83 
 
 		 195 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  68.75 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  68.8 
 
 		 132 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  65.19 
 
 		 203 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  65.6 
 
 		 187 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  65.6 
 
 		 187 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  58.17 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  58.17 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  58.17 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  65.6 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  66.41 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  56.86 
 
 		 187 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  61.72 
 
 		 206 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  62.5 
 
 		 182 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  31.68 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  29.92 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  31.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  29.91 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0859  Barstar (barnase inhibitor)  31.53 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0735  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  29.29 
 
 		 141 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  33.93 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>