45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 		 123 aa  248  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1228  Barstar (barnase inhibitor)  56.6 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  36.84 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  44.07 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  44.62 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  38.6 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2617  hypothetical protein  47.62 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  39.66 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1432  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  37.74 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  37.74 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  36.84 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  28.3 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  35.09 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  32.35 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  28 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  27.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  27.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  27.88 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  27.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  27.88 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  53.12 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  27.84 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  27.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  27.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  33.93 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  38.78 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  27 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  35.59 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  53.12 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3697  Barstar (barnase inhibitor)  35.71 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  25.86 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>