13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2617 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0033  barstar (barnase inhibitor)  41.67 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2039  ribonuclease inhibitor barstar  41.07 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0152  YrdF  30.26 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.363111  hitchhiker  0.0000000066355 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0122  YrdF  30.23 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000773419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09780  carbonic anhydrase  42.31 
 
 		 284 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.550137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1562  Barstar (barnase inhibitor)  30.77 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0361  Barstar (barnase inhibitor)  51.52 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4388  barstar (barnase inhibitor)  41.07 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  47.62 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3227  Barstar (barnase inhibitor)  25.93 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5068  barstar (barnase inhibitor)  25.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.069867  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5792  barstar (barnase inhibitor)  25.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>