27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1562 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1562  Barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 
95 aa  191  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3675  hypothetical protein  34.09 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0488  barstar (barnase inhibitor)  41.27 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1171  barstar  41.27 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.011703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0424  barstar  41.27 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2617  hypothetical protein  30.77 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4388  barstar (barnase inhibitor)  43.33 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0122  YrdF  34.15 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000773419 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0152  YrdF  34.15 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.363111  hitchhiker  0.0000000066355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3537  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0467  Barstar (barnase inhibitor)  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03050  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4556  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3535  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.984313  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0467  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03099  predicted barnase inhibitor  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3722  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3428  hypothetical protein  32.22 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0033  barstar (barnase inhibitor)  33.87 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0238  hypothetical protein  34.57 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3626  hypothetical protein  31.11 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.276792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3661  hypothetical protein  31.11 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.183785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3555  barstar  31.11 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559126  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3554  barstar  31.11 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3723  hypothetical protein  31.11 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.339149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5068  barstar (barnase inhibitor)  25.61 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.069867  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5792  barstar (barnase inhibitor)  25.61 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>