51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1228 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1228  Barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  56.6 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  43.84 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  33.98 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  33.98 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3697  Barstar (barnase inhibitor)  32.71 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  31.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  31.07 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  31.07 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  31.07 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  31.07 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  31.07 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  31.07 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  32.2 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  31.07 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  30.1 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  30.1 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  32.5 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  42 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01230  hypothetical protein  39.66 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  30.1 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  30.34 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  33.66 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5068  barstar (barnase inhibitor)  35.94 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.069867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  48.98 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5792  barstar (barnase inhibitor)  35.94 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  42.86 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  42 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  32.67 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  54.84 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  40.32 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2617  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  43.4 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  40.82 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  31.63 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3344  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  39.22 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  47.22 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1432  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  30.95 
 
 		 187 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>