15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3344 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3344  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  223  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389289  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3697  Barstar (barnase inhibitor)  34.94 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  25.77 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  25.77 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  27.06 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  37.21 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3326  barnase inhibitor  35.48 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  42.5 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  25.93 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1432  hypothetical protein  41.51 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  24.72 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  24.39 
 
 
203 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  28.95 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1228  Barstar (barnase inhibitor)  51.85 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>