46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2602 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  84.95 
 
 
186 aa  328  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  83.42 
 
 
187 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  83.42 
 
 
195 aa  317  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  83.42 
 
 
187 aa  317  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  83.42 
 
 
187 aa  317  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  83.42 
 
 
187 aa  317  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  83.42 
 
 
187 aa  317  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  83.42 
 
 
187 aa  317  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  83.6 
 
 
195 aa  316  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  80.85 
 
 
187 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  80.95 
 
 
188 aa  306  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  80.85 
 
 
187 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  80.85 
 
 
187 aa  306  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  80.85 
 
 
187 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  80.85 
 
 
187 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  80.32 
 
 
187 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  92.42 
 
 
132 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  58.85 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  55.5 
 
 
207 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  55.5 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  75.56 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  54.73 
 
 
202 aa  204  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  71.76 
 
 
132 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  65 
 
 
141 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  68.8 
 
 
139 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  62.14 
 
 
141 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  62.14 
 
 
141 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  67.19 
 
 
159 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  68.99 
 
 
131 aa  190  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  64.06 
 
 
141 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  59.44 
 
 
187 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  64.06 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  64.8 
 
 
149 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  62.6 
 
 
182 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  60.31 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  32.35 
 
 
141 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  29.92 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  34.88 
 
 
137 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  32.94 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  34.44 
 
 
121 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0735  hypothetical protein  30.11 
 
 
118 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  35.56 
 
 
141 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  33.33 
 
 
123 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0859  Barstar (barnase inhibitor)  38.98 
 
 
118 aa  40.8  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>