36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0247 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  96.69 
 
 		 206 aa  308  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  69.23 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  64.18 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  57.89 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  66.92 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  64.66 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  66.15 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  62.41 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  62.41 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  62.41 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  62.41 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  62.41 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  62.41 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  62.41 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  62.41 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  62.41 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  62.41 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  61.76 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  62.41 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  62.41 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  62.41 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  62.6 
 
 		 132 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  62.5 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  62.5 
 
 		 141 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  61.65 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  62.6 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  60.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  62.5 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  64.84 
 
 		 132 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  58.91 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  58.91 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  61.72 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  62.02 
 
 		 131 aa  165  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  60.94 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  58.33 
 
 		 192 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>