47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3437 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  98.93 
 
 
195 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  86.77 
 
 
188 aa  328  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  86.7 
 
 
187 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  86.7 
 
 
187 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  86.7 
 
 
187 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  86.17 
 
 
187 aa  325  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  86.17 
 
 
187 aa  325  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  85.03 
 
 
186 aa  324  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  83.42 
 
 
187 aa  321  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  84.04 
 
 
187 aa  317  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  83.42 
 
 
186 aa  317  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  100 
 
 
132 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  60.89 
 
 
203 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  60.42 
 
 
198 aa  218  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  57.71 
 
 
207 aa  217  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  57.21 
 
 
207 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  57.43 
 
 
202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  71.2 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  70.99 
 
 
132 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  68.8 
 
 
139 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  63.83 
 
 
159 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  64.62 
 
 
141 aa  191  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  64.62 
 
 
141 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  65.6 
 
 
141 aa  188  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  67.44 
 
 
131 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  65.6 
 
 
187 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  63.64 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  62.41 
 
 
182 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  60.15 
 
 
206 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  63.2 
 
 
149 aa  175  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  31.73 
 
 
141 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  35.63 
 
 
137 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5991  Barstar (barnase inhibitor)  31.37 
 
 
141 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  35.29 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  37.35 
 
 
121 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12760  Barstar (barnase inhibitor)  27.88 
 
 
123 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  32.47 
 
 
129 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>